在建设工程施工合同中，双方可以约定由建设单位代为缴纳施工单位的工伤保险费，该约定合法有效。

工伤保险是用人单位（施工单位）的法定义务。虽然建设单位可以代扣代缴部分费用（如在一些特定政策下），但不能通过合同约定将法定义务转移给建设单位，从而免除施工单位的缴纳责任。任何免除法定义务的约定均无效。