接收证书颁发后，工程的所有风险（包括自然灾害、意外事故等）均由发包人承担，承包人仅对缺陷责任期内的质量缺陷负责。

正确。接收证书颁发后，工程的占有和风险转移至发包人。此后发生的自然灾害、意外事故等风险由发包人承担。承包人的责任主要集中在缺陷责任期内对工程本身质量缺陷的修复义务，不再承担工程整体运营或意外风险。